ביחידת גידולי מערכת העיכול אנו מטפלים בסוגים שונים של גידולים: מהושט, קיבה, מעי גס וכן גידולי הלבלב כיס ודרכי המרה. הטיפול בגידולים אלה הינו משולב וכולל טיפולים כימותרפיים, ביולוגיים וכן טיפולים אימונותרפיים. בנוסף במכון מתנהלים מחקרים קליניים בתחום גידולי מערכת העיכול בעיקר בגידולי הקיבה והלבלב.