במחלקת האשפוז של המערך ההמטולוגי מאושפזים חולים עם ממאירויות המטולוגיות, לדוגמא: לוקמיה לסוגיה השונים, מיאלומה נפוצה, לימפומות וכו', הזקוקים לטיפולים כימותרפיים וביולוגיים במסגרת האשפוז. כמו כן מאושפזים חולים עם מחלות המטולוגיות שאינן ממאירות לדוגמא: אנמיה לסוגיה השונים וחסרים נוספים במרכבי הדם הזקוקים לבירור וטיפול. עוד מאושפזים במחלקה חולים המטולוגיים ואונקולוגיים הסובלים מסיבוכי טיפול, וכן חולים הזקוקים לבירור המטולוגי בשל חשד למחלה לבירור מקיף וטיפול.
