והשתלת מח עצם ילדים של בית חולים הדסה אחראית על הטיפול בארבעה תחומים עיקריים ברפואת ילדים: מחלות גידוליות (אונקולוגיה), מחלות דם (המטולוגיה), מחלות של מערכת החיסון (אימונולוגיה) והשתלות מח עצם. המחלקה נותנת מענה רב-מקצועי מקיף בתחומים אלה לכל אוכלוסיית הילדים של ירושלים והסביבה, וכן לילדים המופנים מאיזורים מרוחקים בארץ ובחו”ל.